Proteomics richt zich op de dynamische beschrijving van genregulatie, kwantitatieve bepaling van eiwitniveaus van genexpressie, identificatie van de effecten van ziekten en geneesmiddelen op levensprocessen en uitleg van het mechanisme van genexpressieregulatie. Als wetenschap is proteomics-onderzoek niet van nul Aanvankelijk is het een uitbreiding van het eiwitprofiel (peptide) en de genproductmappingtechnologie die al meer dan 20 jaar wordt gebruikt. Peptide mapping is gebaseerd op tweedimensionale gel elektroforese (2-DE) en verdere beeldanalyse; en gen Het productprofiel is afhankelijk van een verscheidenheid aan analyses na scheiding, zoals massaspectrometrie, aminozuursamenstellingsanalyse, enz.
Door het bestaan van variabele bewerking en RNA-bewerking kunnen veel genen een verscheidenheid aan verschillende eiwitten uitdrukken. Daarom is de complexiteit van het proteoom veel hoger dan de complexiteit van het genoom.
Als de hele genoomsequentie van een soort is ontcijferd, betekent dit niet dat het proteoom van die soort ook is ontcijferd. De specifieke analyse van het eiwitproduct van een gen moet worden bepaald door het genoomniveau, transcriptieniveau en vertaalniveau volledig te wijzigen en te reguleren.